Indice degli argomenti
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Docente: Prof. Fulvio Cruciani
Google Meet link: https://meet.google.com/dqh-cupt-oxo
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IL CORSO DI GENETICA DI POPOLAZIONI PER L'AA 2023-24 SI TERRA' NEL PRIMO SEMESTRE
Il corso inizierà mercoledì 11 ottobre 2023 alle ore 16 e si terrà esclusivamente in presenza (Aula serra 2 - edificio di genetica CU022)
Orario lezioni: lunedì e mercoledì ore 16
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Il docente riceve tutti i giorni, previo appuntamento
Chiamare 06 49912826 oppure scrivere a fulvio.cruciani@uniroma1.it
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Gli esami si svolgono presso l'edificio di genetica.
L'aula sarà indicata su infostud o comunicata il giorno stesso in sede
Per le date definitive fare riferimento ad infostud.
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- La variabilità genetica entro- e tra popolazioni:
La variabilità genetica a livello molecolare
Frequenze alleliche e genotipiche
L'equilibrio di Hardy-Weinberg (HW)
Test per l'equilibrio di HW
Equilibrio di HW per sistemi multiallelici poliploidi e X-linked
Applicazioni della legge di H-W
Aplotipi e linkage disequilibrium (LD)
Applicazioni del LD
- Unione non casuale:
L’inincrocio e l'esoincrocio
Calcolo del coefficiente di inincrocio F di un individuo.
Il coefficiente di inincrocio nelle popolazioni.
Sistemi regolari di unione tra consanguinei; autofecondazione.
Accoppiamento assortativo positivo e negativo
La suddivisione della popolazione e l'effetto Whalund.
- Misure di diversità genetica:
FST, Eterozigosità, diversità nucleotidica e diversità aplotipica.
- Le forze evolutive:
1) Deriva genetica casuale. La distribuzione binomiale. Colli di bottiglia ed effetti del fondatore.
Dimensione efficace della popolazione: diverso numero di maschi e di femmine, varianza riproduttiva, variazioni nel tempo
2) Mutazione
3) Selezione. La teoria della selezione naturale. Modelli di selezione. Fitness assoluta, relativa e media. Selezione positiva e negativa,
Modelli di selezione: contro recessivo, contro dominante, vantaggio dell'eterozigote, svantaggio dell'eterozigote, selezione nei caratteri quantitativi (cenni).
4) Migrazione. Il modello dell'isola, il modello dell'arcipelago.
5) Equilibrio tra forze evolutive: mutazione-deriva; mutazione-selezione, deriva-selezione, deriva-migrazione.
- Le tracce molecolari della selezione:
Eccesso di varianti rare: il test di Tajima.
Eccesso di alleli derivati: il test di Fay e Wu.
Extended haplotype homozigosity test.
Il confronto tra sostituzioni sinonime e non sinonime: il test Ka/Ks.
- Il sequenziamento dei genomi come strumento per ricostruire la storia del popolamento umano
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In questa sezione sono raccolti software, articoli ed altro materiale utilizzato a lezione
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Software Allele A1 - Autore Scott Freeman
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John H Relethford: Genetica delle popolazioni umane. (CEA, 2013)
in alternativa:
Philip W Hedrick: Genetics of populations. (Jones and Bartlett, 2005)