Section: 8. DATA ANALYSIS AND MOLECULAR DYNAMICS: PCA AND COLLECTIVE COORDINATES | COMPUTATIONAL BIOPHYSICS 23_24 | Moodle Sapienza

Home Calendar Corsi

Informazione sull'utilizzo dei materiali didattici

Tutti i diritti relativi ai materiali didattici e ai contenuti presenti in piattaforma sono riservati a Sapienza e ai suoi autori.
È consentito l'uso personale dello stesso da parte degli studenti e del personale Sapienza ai fini di formazione o studio.
Ne è vietata nel modo più assoluto la diffusione, duplicazione, cessione, trasmissione, distribuzione a terzi o al pubblico pena le sanzioni applicabili per legge.

SUPPORTO

Per essere supportati nella manutenzione dei corsi e per qualsiasi chiarimento sul funzionamento di Moodle i docenti possono inviare una mail a: supportoelearningsapienza@mtouch.it

Documentazione Moodle

COMPUTATIONAL BIOPHYSICS 23_24

COMPUTATIONAL BIOPHYSICS 23_24 Back to Course

Section outline

LECTURES N. 19 and 20
Introduction to Principal Components Analysis (PCA)
Dealing with multivariate contexts in which several correlated variables interfere in a phenomenon, the idea is to
LINEAR transform the original variables into uncorrelated ones that are ordered following their variance. The low variance transformed variables can be neglected, realizing a dimensional compression of the initial data.
Protein essential dynamics as PCA. The principal components associated to the multi-dimernsional protein dynamics are
collective coordinates of potential biological meaning.
STUDY MATERIALS IN CB-23_24_PACK_8
- Select activity CB_23_24_PACK_8
  
  CB_23_24_PACK_8 File
  
  Students must
  
  Mark as done
  
  Slides and supplementary materials on PCA Essential Dynamics of proteins, collective coordinates