Buonasera Professore,
Non ho ben capito il ruolo del magnesio non catalitico all'interno di GyrA e quindi come l'interazione dei sostituenti in 3 e in 4 con il magnesio rappresenti un punto chiave per il binding chinolone-enzima
La ringrazio
Il magnesio non catalitico serve per tenere fermo il DNA nel complesso. Notmalmente e' sempre presente in complessi che interessano acidi nucleci.
I sostituenti 3 (carbossile) e 4 (carbonile) si legano al Mg2+ con una forma bidentata.
Questo e' nettamente visibile con un sistema di grafica molecolare come Chimera UCSF utilizzando il complesso 2XCT (https://www.rcsb.org/structure/2XCT).
Nella figura allegata nella sinistra vedi il Mg2+ che viene complessato dalla ciproflossacina e a destra il Mg2+ catalitico
Spero sia chiaro
ok ho capito!
La ringrazio
Buona serata
Bene, ti ringrazio di aver usato elearning.
Se continuate cosi' diventera' sicuramente un repository di domande/risposte molto utile a tutti