ORARIO DELLE LEZIONI A.A. 2020-21

Le lezioni del corso di Genomica Vegetale (Proff. Ferrari e Taddei) per la Laurea Magistrale in Biotecnologie Genomiche Industriali ed Ambientali (LM8) inizieranno il giorno 1/3/2021 con il seguente orario:

Lunedì e mercoledì 9:00-11:00 Aula 218bis Edificio di Fisiologia Generale

Le lezioni si terranno in modalità "blended" e sarà possibile seguirle online ai seguenti indirizzi:

LUNEDI' (Prof.ssa Taddei): meet.google.com/vij-ddbc-xoc

MERCOLEDI' (Prof. Ferrari): https://meet.google.com/ieo-brih-epg

Eventuali modifiche verranno tempestivamente comunicate. 

CONTENUTI DEL CORSO

INTRODUZIONE

Organismi vegetali: struttura, caratteristiche, sviluppo. Organelli vegetali. Riproduzione nei vegetali. Concetti base di genetica. Nascita dell’agricoltura. Biotecnologie applicate agli organismi vegetali. Breeding tradizionale. Colture cellulari e micropropagazione. Trasformazione genetica transiente e stabile.  Geni reporter. Tecniche di biologia molecolare, biochimica e biologia cellulare applicate ai vegetali.

ELEMENTI DI GENOMICA STRUTTURALE DELLE PIANTE E GENETICA AGRARIA

Polimorfismi genetici. Marcatori genetici e molecolari. Mappe genetiche e fisiche. Mappatura di un gene. Recombinant Inbred Lines. Studio dei genomi vegetali: metodologie. Genome sequencing ed assemblaggio. Evoluzione dei genomi vegetali. DNA ripetitivo; poliploidia; sequenziamento dei genomi; esempi di genomi vegetali: Arabidopsis thaliana, riso, pomodoro. Genomica comparativa; individuazione di geni ortologhi in specie diverse, sintenia. Database dei genomi vegetali. Genome-wide association studies.  QTL.

Genoma plastidico: struttura, organizzazione. Ingegneria genetica: metodologie, applicazioni.

TRASCRITTOMICA APPLICATA ALLA BIOLOGIA VEGETALE E AL MIGLIORAMENTO DELLE COLTURE

Metodologie: ESTs, cDNA-AFLPs, Microarrays, DNA Chips, RNA-Seq.  Analisi trascrittomica su singola cellula o singoli tessuti: laser capture; FACS su protoplasti marcati con proteine fluorescenti.  Database dei trascrittomi vegetali. Networks e analisi di correlazione dell’espressione di più geni. Uso della trascrittomica per identificare nuovi geni.

GENOMICA FUNZIONALE DELLE PIANTE

Genetica diretta ed inversa. Mutagenesi. Screening e identificazione di mutanti. Mappatura di mutazioni. Mutanti inserzionali (T-DNA, trasposoni). Tilling. Genome editing. Genome-Wide Association Studies.

EPIGENOMICA DELLE PIANTE

Modifiche epigenetiche: metilazione del DNA; modifiche istoniche; RNA non codificanti: siRNA, microRNA, lncRNA; silenziamento genico trascrizionale e post-trascrizionale; ruolo del silenziamento nel mantenimento dell’integrità del genoma. Generazione e mantenimento delle modifiche epigenetiche; epialleli; analisi su larga scala dell’epigenoma; trasposoni. Imprinting genomico.

GENOMICA APPLICATA AL MIGLIORAMENTO DELLE COLTURE

Domesticamento delle piante coltivate. Esempi di geni importanti nell’addomesticamento delle principali specie coltivate. Sviluppo di nuove varietà vegetali.