A tutti gli studenti che hanno frequentato le esercitazioni. 

Nella cartella riportata al link https://elearning.uniroma1.it/mod/folder/view.php?id=75718 troverete una sottocartella "compito" in cui ci sono le pubblicazioni da prendere. Ogni gruppo deve prendere quella corrispondente alla lettera assegnata durante l'ultima esercitazione di giovedi 20 maggio.

Trovate il tempo di leggere la pubblicazione e durante le esercitazioni il compito sara':

1) con marvin sketch disegnare tutte le molecole in oggetto di studio nella pubblicazione e salvarle in formato smiles

2) sempre con marvin sketch dovranno calcolarsi i seguenti parametri chimico fisici: logP, Solubilita' in H2O, Polar Surface Area, Molecular Surface Area e descrittori geometrici (Steric Hindrance, minimal projection area, minimal projection radius, maximal projection radius, maximal distance to the min proj, maximal distance to the max proj, Volume di van der Waals), H bond donor/acceptor e refractivity.

3) salvare i dati in una tabella di libreoffice calc

4) applicate tutto quello che avete fatto per l'esercitazione sulla QSAR

5) calcolate con BALLOON 20 conformazioni per ogni molecola

6) con SHAEP allineate (sovrapponente) ogni molecola alla piu' attiva della serie

7) provate a delineare una relazione struttura/attivita' di tipo tridimensionale (gruppi funzionali sovrapposti) 

8) salvate tutto in una pennetta usb (serve per terminare giovedi'), copiatevi anche i programmi chimera e chemaxon.

9) a scelta si puo' decidere che quanto fatto sulle molecole della pubblicazione puo' essere usato come argomento di esame tipo una tesina.

Chi vuole puo' anche cominciare prima di lunedi con il proprio PC.

Buon fine settimana