Nell'A.A. 2016/2017 il corso si terrà in lingua inglese. Programma, informazioni generali e materiale didattico sono disponibili sul sito del corso "MOLECULAR METHODS"Per gli studenti che hanno seguito il corso negli anni precedenti, il materiale didattico rimarrà disponibile presso questo sito METODOLOGIE MOLECOLARI NELLA RICERCA BIOMEDICA(A.A. 2015/2016)Obiettivi formativi del corso
Scopo del corso è di acquisire una conoscenza approfondita di alcune delle metodologie molecolari più avanzate, come le tecniche di deep sequencing, di analisi a singola molecola, e di genome editing. Particolare attenzione sarà dedicata alle applicazioni di queste tecniche alla ricerca di base e alla diagnosi biomedica.PROGRAMMA DEL CORSO
Sequenziamento di nuova generazione: metodi e applicazioni
Metodi Storia del sequenziamento del DNA. Il Progetto Genoma Umano Next Generation Sequencing (deep sequencing) NGS Platforms e metodologie di sequenziamento utilizzate Sequenziamento di Terza Generazione: sequenziamento a singola molecola Tecnologie emergenti
Applicazioni RNA-seq: un metodo per l’analisi del trascrittoma ChIP-seq: studio a livello genomico delle interazioni proteina-DNA. Mapping dei nucleosomi e delle modificazioni degli istoni Metagenomica e microbiomica Verso una medicina personalizzata: prospettive e problematiche
Tecniche di analisi a Singola Molecola e Super Microscopia
Studiare singole molecole AFM (Atomic Force Microscopy) Molecular tweezers Single molecule FRET
Dalla Microscopia alla Nanoscopia: oltre i limiti della fisica STED (Stimulated Emission Depletion) STORM (Stochastic Optical Reconstruction Microscopy) Applicazioni e limiti dei sistemi a singola molecola
Tecniche avanzate di studio della funzione genica
Metodologie per lo studio della localizzazione e funzione di macromolecole Visualizzazione in situ di acidi nucleici e proteine Tecniche di RNA interference (gene knockdown, RNAi nella terapia medica)
Mutare il patrimonio ereditario in modo specifico: Genome Editing Gene targeting mediante nucleasi sito-specifiche ZFNs (Zinc Finger Nucleases), TALENs (transcription activator-like effector nucleases) La rivoluzione CRISPR/CAS: un sistema semplice e potente di manipolare il genoma Applicazioni, prospettive e potenzialità del sistema CRISPR/CAS
Sono previste esercitazioni sui seguenti argomenti: NGS su sistema Illumina Microscopia a Forza Atomica Visualizzazione di macromolecole TESTI DI RIFERIMENTO
Per le conoscenze di base
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- Profesor: STEFANO CACCHIONE