Nell'A.A. 2016/2017 il corso si terrà in lingua inglese. Programma, informazioni generali e materiale didattico sono disponibili sul sito del corso "MOLECULAR METHODS"
Per gli studenti che hanno seguito il corso negli anni precedenti, il materiale didattico rimarrà disponibile presso questo sito
METODOLOGIE MOLECOLARI NELLA RICERCA BIOMEDICA (A.A. 2015/2016)
Obiettivi formativi del corso Scopo del corso è di acquisire una conoscenza approfondita
di alcune delle metodologie molecolari più avanzate, come le tecniche di deep sequencing, di analisi a singola
molecola, e di genome editing. Particolare
attenzione sarà dedicata alle applicazioni di queste tecniche alla ricerca di
base e alla diagnosi biomedica.
PROGRAMMA DEL
CORSO Sequenziamento di nuova generazione: metodi e applicazioni Metodi Storia del sequenziamento del DNA. Il Progetto Genoma Umano Next Generation Sequencing (deep
sequencing) NGS Platforms e metodologie
di sequenziamento utilizzate Sequenziamento di Terza
Generazione: sequenziamento a singola molecola Tecnologie emergenti Applicazioni RNA-seq: un metodo per
l’analisi del trascrittoma ChIP-seq: studio a livello
genomico delle interazioni proteina-DNA. Mapping dei nucleosomi e delle
modificazioni degli istoni Metagenomica e microbiomica Verso una medicina personalizzata:
prospettive e problematiche Tecniche di analisi a Singola Molecola e Super Microscopia Studiare singole molecole AFM (Atomic Force Microscopy) Molecular tweezers Single molecule FRET Dalla Microscopia alla Nanoscopia: oltre i limiti della fisica STED (Stimulated Emission
Depletion) STORM (Stochastic Optical Reconstruction
Microscopy) Applicazioni e limiti dei sistemi
a singola molecola Tecniche avanzate di studio della funzione genica Metodologie per lo studio della
localizzazione e funzione di macromolecole Visualizzazione in situ di acidi nucleici e proteine Tecniche di RNA interference (gene knockdown, RNAi nella terapia medica) Mutare il patrimonio ereditario
in modo specifico: Genome Editing Gene targeting mediante nucleasi sito-specifiche ZFNs (Zinc Finger Nucleases), TALENs
(transcription activator-like effector nucleases) La rivoluzione CRISPR/CAS: un
sistema semplice e potente di manipolare il genoma Applicazioni, prospettive e potenzialità del sistema CRISPR/CAS Sono previste esercitazioni sui seguenti argomenti: NGS su sistema Illumina Microscopia a Forza Atomica Visualizzazione di macromolecole
TESTI
DI RIFERIMENTO Per le conoscenze di base
• From Genes to Genomes –
Dale et al., Wiley-Blackwell eds. *
• Genomi
3 (capitoli 1-6) – Brown TA, Edises
• Biologia
Molecolare del Gene (sesta edizione) (cap. 21-22) – Watson et al.,
Zanichelli ed.
• Biologia
Molecolare del Gene (settima edizione) (cap. 7; parte 6, Appendice) –
Watson et al., Zanichelli ed. Testi specifici
• Next-Generation DNA Sequencing Informatics – Brown, CSHL press #
• Atomic Force Microscopy For Biologists – Morris et al., Imperial College Press #
• Articoli
di letteratura (disponibili sul sito del corso)
* Disponibile
presso la biblioteca di Dipartimento (Antropologia)
# Disponibile presso lo studio del docente (Fisiologia
Generale, 1°piano, Stanza 10)
Le lezioni in PDF e gli articoli ai quali fare riferimento
saranno disponibili sul sito del corso sulla piattaforma e-learning http://elearning2.uniroma1.it
|